Biyogaz işleminden sonra ortaya çıkan gübre sıvısı besleyici özelliğe sahiptir ve zengin organik madde içeriğine sahiptir.
Biyogaz prosesinin son aşaması olan hijyenizasyon ünitesinde zararlı maddelerden arınarak biyogaz separatöründen sıvı gübre çıkar ve lagün havuzlarında depolanarak tarımsal faaliyetler için tarlalarda kullanıma hazır hale getirilir.